伊人久久综合社区精品久久 干货满满 | 一文了解若何发类器官模子著作,看这篇十实足!

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    伊人久久综合社区精品久久 干货满满 | 一文了解若何发类器官模子著作,看这篇十实足!

    发布日期:2023-05-25 12:13    点击次数:185

    伊人久久综合社区精品久久 干货满满 | 一文了解若何发类器官模子著作,看这篇十实足!

    类器官行动生物体内效应和体外模子之间的转动桥梁,被称为21世纪最大的本领改造之一,可使体外发现快速过渡至临床,并被公认在异日的个性化医疗中弘扬中枢作用。类器官本领马上发展,已成为肿瘤策画的最好模子,并被预想为下一个诺贝尔奖。本文咱们将通过客岁4月发表在Nature communications的一篇著作“Integrated profiling of human pancreatic cancer organoids reveals chromatin accessibility features associated with drug sensitivity”若何使用类器官发表高分著作的表率。

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    一、策画念念路

    1. 类器官构建:竖立胰腺癌类器官,武断其组织学特征;

    2. 类器官遗传信息武断:武断胰腺癌类器官中特征性的基因组改造

    3. 非编码突变与药物敏锐性的关系:通过全基因组、全外显子组及转录组玄虚分析非编码RNA突变与胰腺癌类器官对药物敏锐性的关系;

    4. 体内模子及临床数据考据:通过类器官异种移植模子及原发肿瘤患者临床随访数据考据类器官不错准确反馈患者的药物敏锐性。

    二、策画实质

    第一步:需要证明咱们构建出类器官,且类器官具有与原发肿瘤访佛的组织形式和抗原抒发;

    策画表率及效率:

    a: 竖立胰腺癌类器官的过程;

    c: 胰腺癌类器官的组织学特征武断。

    Figure1:胰腺癌类器官的构建

    第二步:通过测序本领武断类器官的遗传信息改造(突变变异与拷贝数变异),浅薄进行下一步;

    策画表率及效率:

    Figure 2:全基因组测序检测胰腺癌类器官是否具有胰腺癌特征性的基因突变;

    Figure 3:转录组测序检测胰腺癌多样分型的特异性基因是否高抒发;

    Figure 4:转录组测序贯串染色质通达测序(ATAC)分析探索特定胰腺肿瘤类型的不同转录因子;

    Figure2:类器官的全基因组测序

    Figure3:类器官的转录组测序

    Figure 4:类器官转录组与ATAC测序贯串分析

    第三步:通过对测序信息的分析(可一种,可多种),判断不同基因特征与药物敏锐性的关联性(很蹙迫);

    策画表率及效率:

    a:31个被武断出的非编码突变的基因;

    b-c:ATAC-Seq峰表里非编码突变的比例及倍数;

    d: 武断出的特异基因RIMBP2增强子的染色质可及性及在胰腺癌类器官中的抒发;

    e:RIMBP2增强子基因座的归一化轨迹分析;

    f:分析RIMBP2上下抒发TCGA部队中胰腺癌患者的总糊口期;

    l-m:在chr10特定序列中峰值处具有较高染色质可及性的类器官具有对氟尿嘧啶和紫杉醇权贵的抗性。

    Figure5. 药物敏锐性关联的染色质可及性特征的关联性

    第四步:通过类器官预想临床援助药物敏锐性,评释可行动个体化援助的前瞻模子(最蹙迫)。

    策画表率及效率:

    a:39种外分泌模子中类器官会诊临床援助药物敏锐性的AUC值;

    b: 临床分析过程;

    c: 检测三组(敏锐组、耐药组及中间组)胰腺癌患者无复发糊口期;

    d:敏锐组和耐药组影像学随访尊府;

    e-g:类器官异种移植体内模子对吉西他滨、氟尿嘧啶、紫杉醇药物测试效率。

    Figure 6. 类器官预想临床药物援助敏锐性的效率

    总而言之,类器官在肿瘤策画领域中具有极高的革命性和可靠性,关于类器官的策画连年来亦然激越不断,通过上述表率奥秘使用类器官进行策画可助力咱们发表高分著作。

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    非编码胰腺癌模子器官药物发布于:北京市声明:该文不雅点仅代表作家本东说念主,搜狐号系信息发布平台,搜狐仅提供信息存储空间处事。

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